生態(tài)系統(tǒng)多樣性指的是一個地區(qū)的生態(tài)多樣化程度。它區(qū)別于物種多樣性，物種多樣性指的是物種的種類而不是生態(tài)系統(tǒng)。而生態(tài)系統(tǒng)多樣性涵蓋的是在生物圈之內現(xiàn)存的各種生態(tài)系統(tǒng)（如森林生態(tài)系統(tǒng)，草原生態(tài)系統(tǒng)）也就是在不同物理大背景中發(fā)生的各種不同的生物生態(tài)進程。